Holidays are a productive time, I wrote a bash script w
hich converts fasta files to a scrolling DNA helix. Enjoy 8D https://t.co/BKyaHPbkRm#bioinformatics #DNA #pixelart pic.twitter.com/j1MXG44JPu— hackseq (@hackseq) 2018年1月2日
動画を見ると楽しそうだし真似してみようと.scriptを入手.中を見ると .fa というファイルが必要なよう.
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*.fa は FASTA というソフトウェアの形式らしい.FASTA はシーケンスアライメントを行うソフトウェアらしい.
ソフトウェア自体もヴァージニア大学のsiteから入手できるようだけどWikipediaにページに例があったので今回はそれを使ってみる.
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そしてこんな感じに.
macOSの場合は要patchだそう
sed on mac is a pain. Fix is in line 70.
On mac: Rem
ove the trailing hyphen (STDIN is default) and replace \n with a literal newline pic.twitter.
com/fEhO2c99ou— Heiko Horn (@hornheiko) 2018年1月2日